目前，我国畜禽养殖粪便所含污染物的化学需氧量已超过全国工业废水与 生活污水的化学需氧量，造成氮和磷的大量流失。畜禽养殖污染物的排放已成 为农业面源污染的主要来源。畜禽养殖业产生的污染物为：一是畜禽粪便；二是污水污染；三是气体污染。目前，国外常见的畜禽养殖污染物的处理技术主要是将粪便、污水和气体分离，分别进行处理的工艺。粪便分离后利用堆肥技术回收其中的营养元素和能量，是较为成熟的粪便处理技术；污水处理采用较多的是通过SBR法及厌氧-好氧组合工艺去除其中的BOD、N和P；而对于废气的处理则普遍采用生物除臭技术。
        我国在发展畜禽养殖业的同时却忽视了污染防治工作，国 家环保总局在全国23个省市进行的调 查发现，全国90%的规模化畜禽养殖未经过环境影响评价，80%的养殖场缺乏必要的污染防治措施。目前，国内对畜禽养殖污染物的处理多采用分而治之的方法，如养殖粪便等干物 质进行堆肥后还田，养殖污水采用生化法如SBR、稳定塘等工艺进行处理，养殖场产生的废气采用滴滤塔进行处理。上述方法和工艺将畜禽养殖污染物分而 治之的方式通常在设计和实施操作上困难较大、工艺流程复杂、运行管理难度 大，养殖场废水、废气的处理效率低以及基建、能耗及运行费用高的问题。